產品介紹：

最短的時間內獲得答案，智能化的工作流程，廣泛的測序應用范圍     

 Illumina公司推出的MiSeq是目前唯一一臺在單個儀器上整合了擴增、測序和數據分析的新一代測序儀，每次運行能產生超過1 Gb的數據，且占地面積僅為2平方英尺。MiSeq有著革命性的流程和無可比擬的準確性，這讓它成為快速且經濟高效的遺傳分析的理想平臺，適合廣泛的應用。同時根據Illumina的最新消息，今年9月份左右，MiSeq系統的測序通量將會升級至7G左右。升級將通過兩個方面完成，一個是cluster密度的增大，升級后cluster密度將會增加至12-15million，而pair-end讀取的reads數目將會增加至24-30million；另一方面是通過測序讀長而提升通量，屆時測序讀長會達到2*250bp，同時測序速度也會有所提升。目前，Broad研究院已經利用現有試劑實現了單端測序300bp讀長，Illumina目前內部測序更是完成了2*400bp的pair-end測序。而這些，都是保證在高質量數據結果的前提下完成的。

MiSeq性能參數

 1.技術規格

▲1.1高數據通量：每輪反應最高可生成15G的有效數據；通量可以根據不同要求調整；

1.2每次運行可生成可讀2500萬個測序片段標簽序列；

1.3每輪實驗運行成本：測序150億（15G）個堿基對所需成本不高于2000美元；成本包含了從樣本前期建庫-克隆擴增-測序-數據分析的所有成本；

▲1.4有效數據讀長：單端讀取序列，讀長可達300個堿基；雙端讀取序列：讀長可達2x300個堿基 。讀長可根據不同的應用而調整；

▲ 1.5 拼接前原始數據質量評判采用的測序質量標準為Q30，并且高于Q30的堿基比例是整個運行的平均結果；

▲1.6實驗流程:樣本文庫制備只需要90分鐘。之后在同一系統中直接開展自動克隆擴增－測序－數據分析。整個過程不需要繁瑣的emulsion 實驗，人工干預的時間少于1小時；

▲1.7無需單獨的擴增設備，所有樣本的克隆擴增, 測序到數據分析都在同一臺儀器中自動完成，無需人工干預；

1.8 多重擴增子測序的每次反應最多可同時檢測384個樣本，每個樣本可同時分析1536條產物?？筛鶕煌瑢嶒炐枰x擇樣本通量；

1.9 廠家能夠提供商品化的應用試劑供用戶日常選擇使用，比如：

     檢測自閉癥的試劑；

     檢測靶向主要是針對生殖細胞存在的與腫瘤相關基因的試劑；

     檢測遺傳性疾病的試劑，能夠重點關注嬰幼兒早期嚴重的、隱形遺傳??；

  1.10 儀器具備以下軟件分析功能：

?      全基因組重測序

?      定向重測序，包括但不限于下列方法：

o     TruSeq 自定義捕獲

o     TruSeq 自定義擴增子測序

o     長距離片段

o     分子倒置探針

?      De novo 測序

?      序列特異DNA結合蛋白的ChIP-Seq

?      組蛋白修飾和表觀遺傳標記的ChIP-Seq

?      亞硫酸氫鹽處理DNA的測序，DNA甲基化研究

?      宏基因組學研究

?      mRNA測序

?      基于標簽的基因表達

?      小RNA測序

?      核糖體圖譜分析

?      DNase I 超敏位點定位研究

?      核小體定位和染色質結構研究研究

?      CLiP-Seq：研究序列特異的蛋白-RNA相互作用研究

?      CNV-Seq：用測序測定拷貝數變異研究

?      GRO-Seq：研究RNA聚合酶起始研究

?      降解DNA樣品的測序

?      末端配對mRNA測序

?      DNA印跡和等位基因特異的表達

2配置要求

2.1能符合上述指標的測序系統主機1套,包括了樣本文庫自動擴增和數據分析功能；儀器控制服務器配置：Intel Core i7-2710GE 2.10GHz CPU，16GB RAM，750G硬盤，采用Win7 Embedded Standard操作系統；

2.2 96孔磁力架

2.3 核酸蛋白定量儀Qubit

2.4配套控制軟件；

2.5 配套分析報告軟件：開展完整的數據分析無需用戶干預，從質量打分的堿基檢出到變異體檢出和比對所需時間小于4小時；

2.6 相關儀器調試用試劑；

2.7 必需的附件、配件及專用工具等；

3.技術文件

3.1儀器操作使用手冊；

3.2儀器維護的有關資料；

 工作流程

4大特性
1、最短的實驗周期：從樣品制備開始只需要8小時即可得到超過100M的高質量測序結果。
2、最便捷的樣品制備流程：只需50ngDNA模板，2小時的自動化操作就可以完成全部樣品制備工作。
3、最精確的測序原理：MiSeq繼續GA和HiSeq平臺的邊合成邊測序的化學原理，數千篇高質量的國際期刊文章是對Illumina NGS平臺測序結果可信度最有力的證明。
4、最完整的整合功能：MiSeq可以獨立完成簇生成，雙向測序及數據分析工作，讓經費和實驗室空間不再成為NGS研究的障礙。

應用范圍
1、轉錄組測序
派森諾MiSeq測序平臺是基因組已測序物種的轉錄組分析最佳平臺。公司技術團隊目前已完成了包括斑馬魚在內的多種植物、動物的轉錄組測序及分析。
2、宏基因組16S rDNA單V區測序
對16s rDNA的單V區(V3\V4)進行高通量測序，鑒定細菌群和古生菌群。派森諾的技術團隊使用Illumina MiSeq測序16S rDNA V4區并結合Roche 454 FLX+測序16S rDNA V1~V3區成功的對雞的腸道環境細菌進行了鑒定。
3、Small RNA測序
1*35bp的讀長完美地配合了小RNA的測序長度，速度快，靈敏度高。派森諾的技術團隊目前已完成了鵝的小RNA測序和多種中草藥的小RNA測序。

4、重測序：

包括全基因組重測序、簡化基因組測序、外顯子測序。
Illumina MiSeq非常適用于對微生物基因組的重測序，每次運行即可完成一個微生物基因組測序。2011年12月27日，派森諾的技術團隊利用MiSeq一次運行同時完成了乳酸菌
（Lactobacillus casei Zhang和Lactobacillus casei P8）的重測序，基因組覆蓋深度為分別為404倍和213倍，比對至參考序列，基因組覆蓋率為100%，同時檢測到了多種結構變異，包括插入、缺失和SNP位點，并且檢測到了全部質粒。